Znanstvene študije kažejo, da meditacija pozitivno vpliva na delovanje imunskega sistema. Med meditacijo se zmanjšuje izločanje stresnih hormonov, kot je kortizol, ki lahko v večjih količinah oslabi imunski odziv. Hkrati pa se poveča prisotnost protiteles in izboljša splošna celična obramba telesa. Posamezniki, ki redno meditirajo, pogosto poročajo o manj prehladih in boljši odpornosti na sezonske bolezni. Zato ni presenetljivo, da vedno več strokovnjakov za zdravje priporoča meditacijo kot podporo krepitvi imunskega sistema.
